我国科学家开发出叶绿体基因组综合数据库

科研 2022-10-17 17:02

叶绿体是植物将光能转化为化学能的重要细胞器，具有独立的基因组，随着基因测序技术的发展，尽管已发布了海量的植物叶绿体基因组序列，但如何整合应用这些数据目前仍面临数据命名标准不统一、数据信息不全以及较高经济价值的物种尚未进行测序等问题。

近日，发表在《Plant Biotechnology Journal》上题为“Towards comprehensive integration and curation of chloroplast genomes”的研究中，中国科学院北京基因组研究所和中国中医科学院中药资源中心研究人员开发了迄今为止物种数量最多的叶绿体基因组综合数据库Chloroplast Genome Information Resource（CGIR）。该数据库收录了来自11,946个物种的19,388条叶绿体基因组序列，包括利用全国第四次中药资源普查标本自测的718种未发表的叶绿体基因组序列，按照基因组、基因、微卫星序列、DNA条形码、DNA特征序列五个功能模块对数据进行组织与管理。

CGIR数据库通过自主测序、整合公开基因组资源和人工数据审编向用户提供了目前最全面、物种数量最多的叶绿体基因组数据。经审编的物种分类、物种功能、基因名称与序列、分子标记等保证了数据的高度可靠，对植物系统发育、物种鉴定、叶绿体基因工程的发展均具有重要意义。

论文链接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36069606/

注：此研究成果摘自《Plant Biotechnology Journal》，文章内容不代表本网站观点和立场，仅供参考。

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